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    高通量測序基因試驗檢測

    高通量測序基因試驗檢測

    CMA認證科研檢測機構(gòu)

    集體所有制研究所

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    原創(chuàng)版權(quán) 發(fā)布時間:2023-08-09 13:34:05 更新時間:2025-02-26 15:55:14 咨詢量:1 來源:生物醫(yī)藥測試中心

    注意:因業(yè)務(wù)調(diào)整,暫不接受個人委托測試,望見諒。

      北檢(北京)檢測技術(shù)研究院可以針對基因組DNA樣品、轉(zhuǎn)錄組RNA樣品、小RNA樣品、表觀基因組DNA樣品、單細胞樣品等進行檢測,可提供全基因組測序、目標區(qū)域測序、轉(zhuǎn)錄組測序、表觀基因組測序、元基因組測序、單細胞測序、小RNA測序等檢測服務(wù),能夠針對國標、美標等檢測標準對樣品進行檢測,北檢院專注科研測試,致力于推動科技進步,出具的高通量測序基因試驗的檢測報告多方認可。

      檢測樣品

      

    顯微鏡下細胞切片

    顯微鏡下細胞切片

      基因組DNA樣品:用于全基因組測序(Whole Genome Sequencing,WGS)或目標區(qū)域測序(Targeted Sequencing)。基因組DNA樣品可以來自生物體的細胞或組織,如人類、動物、植物等。

      轉(zhuǎn)錄組RNA樣品:用于轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq)。轉(zhuǎn)錄組RNA樣品可以來自細胞或組織,如細胞系、動物組織、植物組織等。

      小RNA樣品:用于小RNA測序(Small RNA Sequencing)。小RNA樣品包括microRNA(miRNA)、small interfering RNA(siRNA)等。

      表觀基因組DNA樣品:用于表觀基因組測序(Epigenome Sequencing),如甲基化測序(DNA Methylation Sequencing)和染色質(zhì)免疫沉淀測序(ChIP-Seq)。表觀基因組DNA樣品可以來自細胞或組織。

      單細胞樣品:用于單細胞測序(Single-cell Sequencing)。單細胞樣品可以來自單個細胞,可以是單個細胞懸液或單個細胞的分離物。

      檢測項目

      全基因組測序(Whole Genome Sequencing,WGS):對一個生物體的完整基因組進行測序,可以用于研究基因組結(jié)構(gòu)、變異、演化等。

      目標區(qū)域測序(Targeted Sequencing):選擇性地測序感興趣的基因或區(qū)域,可以用于研究特定基因的突變、關(guān)聯(lián)分析等。

      轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq):測序細胞或組織中的轉(zhuǎn)錄本,可以用于研究基因表達水平、剪接變異、非編碼RNA等。

      小RNA測序(Small RNA Sequencing):測序小RNA分子,如microRNA(miRNA),可以用于研究miRNA的功能和調(diào)控機制。

      表觀基因組測序(Epigenome Sequencing):測序染色質(zhì)上的表觀遺傳標記,如DNA甲基化、組蛋白修飾等,可以用于研究基因表觀遺傳調(diào)控。

      單細胞測序(Single-cell Sequencing):對單個細胞進行測序,可以研究細胞類型、細胞異質(zhì)性、細胞發(fā)育軌跡等。

      元基因組測序(Metagenome Sequencing):測序環(huán)境樣品中的微生物基因組,可以研究微生物群落結(jié)構(gòu)、功能和代謝能力。

      檢測方法

      樣品準備:根據(jù)實驗?zāi)康倪x擇合適的樣品類型(如基因組DNA、轉(zhuǎn)錄組RNA等),進行樣品提取和純化。這個步驟通常需要使用特定的試劑盒和方法,以獲得高質(zhì)量的核酸樣品。

      DNA文庫構(gòu)建或RNA反轉(zhuǎn)錄:將提取的DNA或RNA樣品進行文庫構(gòu)建或反轉(zhuǎn)錄,生成適用于測序的文庫。文庫構(gòu)建的具體方法會根據(jù)測序技術(shù)和實驗要求而有所不同,常見的方法包括PCR擴增、DNA片段連接、RNA逆轉(zhuǎn)錄等。

      測序平臺選擇:選擇適合的高通量測序平臺進行測序。目前常用的高通量測序平臺包括Illumina HiSeq系列、NovaSeq系列、PacBio Sequel等。不同平臺具有不同的測序原理、測序長度和產(chǎn)出量,選擇合適的平臺要考慮實驗需求和預(yù)算限制。

      高通量測序:將構(gòu)建好的文庫進行高通量測序,生成原始測序數(shù)據(jù)。高通量測序的過程涉及到DNA擴增、測序反應(yīng)、成像和數(shù)據(jù)采集等步驟,具體操作由測序平臺的設(shè)備和軟件完成。

      數(shù)據(jù)分析:對原始測序數(shù)據(jù)進行生物信息學(xué)分析,包括序列質(zhì)量控制、序列比對、變異檢測、基因表達分析等。數(shù)據(jù)分析通常需要使用專業(yè)的生物信息學(xué)工具和軟件,如Bowtie、SAMtools、DESeq2等。

      結(jié)果解讀和驗證:根據(jù)數(shù)據(jù)分析結(jié)果進行結(jié)果解讀,并進行驗證實驗以確認發(fā)現(xiàn)的基因變異、表達差異等。

      檢測儀器

      

    Illumina

      

    PCR

      檢測標準

      T/GDPMAA 0012-2023 高通量基因測序項目分類

      YY/T 1865-2022 BRCA基因突變檢測試劑盒及數(shù)據(jù)庫通用技術(shù)要求(高通量測序法)

      YY/T 1723-2020 高通量基因測序儀

      GB/T 35537-2017 高通量基因測序結(jié)果評價要求

      GB/T 33681.1-2017 高通量基因測序樣本預(yù)處理方法 第1部分:動物組織樣本預(yù)處理

      GB/T 30989-2014 高通量基因測序技術(shù)規(guī)程

      GB/T 40226-2021 環(huán)境微生物宏基因組檢測 高通量測序法

      T/SZGIA 2-2018 人類全基因組遺傳變異解讀的高通量測序數(shù)據(jù)規(guī)范

      T/SZGIA 1.2-2018 基于高通量測序的環(huán)境微生物檢測 第2部分:人糞便微生物宏基因組檢測方法

      T/GDPMAA 0004-2020 基于孕婦外周血漿游離DNA高通量測序無創(chuàng)產(chǎn)前篩查胎兒基因組病技術(shù)標準

      DB32/T 3762.11-2020 新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范 第11部分:全基因組高通量測序

    檢測流程

    1、收到客戶的檢測需求委托。

    2、確立檢測目標和檢測需求

    3、所在實驗室檢測工程師進行報價。

    4、客戶前期寄樣,將樣品寄送到相關(guān)實驗室。

    5、工程師對樣品進行樣品初檢、入庫以及編號處理。

    6、確認檢測需求,簽定保密協(xié)議書,保護客戶隱私。

    7、成立對應(yīng)檢測小組,為客戶安排檢測項目及試驗。

    8、7-15個工作日完成試驗,具體日期請依據(jù)工程師提供的日期為準。

    9、工程師整理檢測結(jié)果和數(shù)據(jù),出具檢測報告書。

    10、將報告以郵遞、傳真、電子郵件等方式送至客戶手中。

    檢測實驗室(部分)

    檢測優(yōu)勢

    1、綜合性檢測技術(shù)研究院等多項榮譽證書。

    2、檢測數(shù)據(jù)庫知識儲備大,檢測經(jīng)驗豐富。

    3、檢測周期短,檢測費用低。

    4、可依據(jù)客戶需求定制試驗計劃。

    5、檢測設(shè)備齊全,實驗室體系完整

    6、檢測工程師專業(yè)知識過硬,檢測經(jīng)驗豐富。

    7、可以運用36種語言編寫MSDS報告服務(wù)。

    8、多家實驗室分支,支持上門取樣或寄樣檢測服務(wù)。

    結(jié)語

    以上是關(guān)于高通量測序基因試驗檢測的檢測服務(wù)介紹,僅展示了部分檢測樣品和檢測項目,如有其它需求或疑問請咨詢在線工程師。

    標簽:高通量測序基因試驗;高通量測序基因試驗檢測
     
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