注意:因業務調整,暫不接受個人委托測試,望見諒。
北檢院檢測平臺-[科研實驗室]可提供RNA pulldown實驗服務,能力覆蓋材料、生物、醫藥研究、醫療器械、化妝品、代謝組學測試、力學老化腐蝕性能測試、毒理學試驗、動物模型實驗、生物分析等。北檢院材料實驗室,根據相關檢測標準,并提供測試報告,可在全國范圍內使用并被認可。
RNA pull-down實驗原理
RNA pull-down是檢測RNA結合蛋白與其靶RNA之間相互作用的實驗手段之一。使用體外轉錄法標記生物素RNA探針,然后與胞漿蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白質復合物。該復合物可與鏈霉親和素標記的磁珠結合,從而與孵育液中的其他成分分離。復合物洗脫后,通過western blot實驗檢測特定的RNA結合蛋白是否與RNA相互作用。質譜實驗檢測特定的RNA結合蛋白鑒定蛋白質類型。
RNA pull-down實驗技術流程
(1)目標RNA的制備及生物素標記。
目標RNA制備的一般流程包括:
構建RNA過表達質粒:基因合成+測序驗證
體外轉錄模板準備:設計含T7啟動子引物;PCR擴增得到轉錄模板
體外轉錄:以PCR產物為模板,體外轉錄得到目的RNA
(2)磁珠富集RNA
(3)RNA結合蛋白孵育
(4)RNA結合蛋白洗脫,銀染質檢:SDS-PAGE電泳銀染檢測富集蛋白的情況
(5)WB或者MS檢測
ChIP、RIP、RNA pull-down、EMSA、熒光素酶報告基因的比較
ChIP:通過與染色質片段共沉淀和PCR技術,在體內檢測與特異蛋白質結合的DNA片段。將處于適當生長時期的活細胞用甲醛交聯后將細胞裂解, 染色體分離并打碎為一定大小的片段200bp-1000bp;然后用特異性抗體免疫沉淀目標蛋白與 DNA交聯的復合物, 對特定靶蛋白與DNA片段進行富集。采用低pH值條件反交聯, DNA與蛋白質之間的 Schiff鍵水解, 釋放DNA片段。通過對目標片段的純化與檢測,獲得DNA與蛋白質相互作用的序列信息。
研究目的:蛋白與DNA結合情況。
RIP:RIP技術(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA結合蛋白免疫沉淀),是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術。運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來,然后經過分離純化就可以對結合在復合物上的RNA進行分析;即用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質中內源性的RNA結合蛋白,防止非特異性的RNA的結合,免疫沉淀把RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來,結合的RNA序列通過microarray (RIP-Chip),定量RT-PCR或高通量測序(RIP-Seq)方法來鑒定。是了解轉錄后調控網絡動態過程的有力工具,能幫助我們發現miRNA的調節靶點。
研究目的:蛋白與RNA結合情況。
RNA pull-down:使用體外轉錄法標記生物素RNA探針,然后與胞漿蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白質復合物。該復合物可與鏈霉親和素標記的磁珠結合,從而與孵育液中的其他成分分離。復合物洗脫后,通過western blot實驗檢測特定的RNA結合蛋白是否與RNA相互作用。
研究目的:蛋白與RNA結合情況。
EMSA:凝膠遷移或電泳遷移率實驗(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術,可用于研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用、DNA定性和定量分析。生物素標記的探針依研究的結合蛋白的不同,可是雙鏈或者是單鏈。
研究目的:蛋白與DNA結合情況。
熒光素酶報告基因:熒光素酶的基因可以被合成并插入到生物體中或轉染到細胞中,將不同類型的細胞(骨髓干細胞、T細胞等)標記上(即表達)熒光素酶,就可以用高敏感度的CCD相機進行對動物體內進行活體觀察而不會傷害到動物本身。在熒光素酶中加入正確的螢光素底物就可以放出熒光,而發出的光子可以被光敏感元件,如螢光探測器或改進后的光學顯微鏡探測到。這就使得對包括感染在內的多種生命活動進程進行觀察成為可能。
研究目的:啟動子激活情況。
北檢院檢測優勢有哪些?
1、多個實驗中心:實驗室管理中心下設檢測檢測中心、科研檢測中心、X射線應用中心。
2、面向眾多學科:面向物理、化工化學、材料、納米、環境、電子、能源等眾多學科。
3、擁有多臺精密檢測儀器。
4、從事多項工作:能夠從事材料微觀結構檢測、定性和定暨檢測、材料性能檢測、材料質量綜合評定等工作。
5、全天化服務時間:提供24小時開放服務、網絡化管理。
6、機構檢測能力:具備向校內外科學研究和品質鑒定提供公正、科研檢測數據能力的重要機構。
以上就是關于RNA pulldown實驗的相關內容,更多檢測需求,你可聯系我們在線實驗室工程師,為您詳細洽談實驗周期及流程問題!
檢測流程
1、收到客戶的檢測需求委托。
2、確立檢測目標和檢測需求
3、所在實驗室檢測工程師進行報價。
4、客戶前期寄樣,將樣品寄送到相關實驗室。
5、工程師對樣品進行樣品初檢、入庫以及編號處理。
6、確認檢測需求,簽定保密協議書,保護客戶隱私。
7、成立對應檢測小組,為客戶安排檢測項目及試驗。
8、7-15個工作日完成試驗,具體日期請依據工程師提供的日期為準。
9、工程師整理檢測結果和數據,出具檢測報告書。
10、將報告以郵遞、傳真、電子郵件等方式送至客戶手中。
檢測實驗室(部分)
檢測優勢
1、綜合性檢測技術研究院等多項榮譽證書。
2、檢測數據庫知識儲備大,檢測經驗豐富。
3、檢測周期短,檢測費用低。
4、可依據客戶需求定制試驗計劃。
5、檢測設備齊全,實驗室體系完整
6、檢測工程師專業知識過硬,檢測經驗豐富。
7、可以運用36種語言編寫MSDS報告服務。
8、多家實驗室分支,支持上門取樣或寄樣檢測服務。
結語
以上是關于RNA pulldown實驗的檢測服務介紹,僅展示了部分檢測樣品和檢測項目,如有其它需求或疑問請咨詢在線工程師。